- Perairan barat Biak
- Perairan utara Biak
- Perairan timur Biak
- Perairan Jayapura - Sarmi
- Samudera Pasifik utara Jayapura
- Laut Banda utara bagian barat
- Laut Banda selatan bagian barat
- Laut Banda selatan bagian timur
- Perairan Sermata - Leti
- Perairan Babar
- Perairan Tanimbar
- Laut Arafuru bagian barat
- Perairan Kai
- Perairan Aru
- Laut Arafuru bagian tengah